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VOLUME-ONEデベロッパグループジャパン

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76.感謝  
名前:河面 倫有    日付:6月5日(月) 20時34分
増谷先生。
 大変貴重な御返事有難う御座います。
 これで、問題を解決出来ました。
 今後とも宜しくお願い致します。

       昭和大学 脳神経外科 河面 倫有

75.Re: [掲示板N0.72再投稿]inport/exportに関しての質問  
名前:増谷佳孝    日付:6月5日(月) 14時39分
河面さま、

@ import時にダイアログで補間(interpolate)することを選択すれば、最も短いボクセル辺に合わせてtrilinear補間を行います。例えば、1mmx2mmx3mmのボクセルサイズだと、1mm^3のボクセルサイズのデータに変換されます。よってmatrix sizeは変わります。

A 上記のように補間を選択していれば、最も短いボクセル辺のpixelサイズになります。しなければそのままですが、ヘッダ内への書き出しはすべて0mmになります。これは、VOLUME-ONEがisotropicなボリュームを前提としているためです。

74.[掲示板N0.72再投稿]inport/exportに関しての質問  
名前:河面 倫有    日付:6月3日(土) 10時4分
分かりにくい日本語で大変失礼致しました。

inport/exportに関しての質問です
 
analyze形式でimportし、画像処理後、同形式でexportしました。
 @import直後に、現在のmatrix sizeが表示され、import時のパラメータと
  違う事に気付きました。具体的にここでどのような処理がされているのか
  教えていただけませんでしょうか
 Aexport後のpixel sizeが分かりませんでした。
  入力時と同じなのでしょうか。

大変恐縮ですが、宜しくお願いいたします。

昭和大学 脳神経外科 河面 倫有

73.Re:データープログラム上での扱いに関して  
名前:増谷佳孝    日付:6月1日(木) 19時44分
#匿名でも構いませんが、お答えできる内容が限定される事をご了承下さい。

文章から推察して、失礼ながら日本語nativeではない方とお見受けしましたが、英語でも構いませんので、質問事項を整理してわかりやすく再度書き込んで下さい。

You may ask in English.

72.データープログラム上での扱いに関して  
名前:mchal    日付:5月31日(水) 14時45分
突然の質問で申し訳ありません。掲示板なのでペンネームで
申し訳ありませんが、mchalと申します。「これでわかる拡散MRI」
dTVSR並びにvolume_one_ver1.72を重宝して使わさせて
頂いております。
データーは、analyzeフォーマットで256x256x20matrix*7ch、pxcel
サイズは(x,y,z)=(0.898438,0.898438,7.2)で入力し処理をして
おります。fiber trackingをdtvSRも使い行っております。

volume_oneで入力直後のinfomationを見ると、256x256x160x7
となっており、rawformatで入力した時と比較して考えると、
iso-pixel化とz軸方向へのデーターの補完がある想像しています。

ここで、是非質問させて頂きたいのですが、
analyzeフォーマットでの出力時に関してですが、
@256x256x160matrixで良いのでしょうか。
Aanalyzeフォーマットでの出力時は、pixel_sizeは入力時と一緒
 の0.898438で、z方向も0.898438と考えて良いのでしょうか。

実際の表示に関してですが、
Cx,y,z軸方向は実際にiso_pixelで表示されているのでしょうか。
 infomationと画面上での実際のピクセル数は一致しているので
 しょうか。(格子の中空間は表示する際に、視覚的都合上何か処理を
 しているのかどうかが知りたいです)

大変恐縮です。よろしくお願いいたします。

71.Re: VOLUME-ONEという名称の使用  
名前:増谷佳孝    日付:5月11日(木) 15時40分
吉村さま、

>VOLUME-ONEという名称は、ほかのプログラムあるいは会社で使われていることはない
>のでしょうか。貴社のオリジナルな名前なのでしょうか。

ドメイン名に関しては、当方の取得しているvolume-one.org, volume-one.jpを除いて、汎用的なもの(.com, .netなど)は概ね空いているようです。5年程このサイトを運営していますが、同名を使用している製品、会社について知りません。

また、当方は営利企業ではなく、大学などの研究者などからなる緩やかなグループです。

増谷@東京大学
http://www.volume-one.org

70.VOLUME-ONEという名称の使用  
名前:吉村佐一郎    日付:5月11日(木) 15時1分
VOLUME-ONEという名称は、ほかのプログラムあるいは会社で使われていることはないのでしょうか。貴社のオリジナルな名前なのでしょうか。

好い名前なので、お聞きしました。

慶應大学 吉村佐一郎

69.To Kyle  
名前:増谷佳孝(Yoshi Masutani)    日付:10月13日(木) 11時50分
For comments and questions on dTV, go to;
http://www3.ezbbs.net/07/dtv_usersgroup/

(This BBS is just for VOLUME-ONE.)

66.Re:The link of manual in english version is not valid.  
名前:増谷佳孝    日付:9月21日(水) 12時17分
? It is really valid. It might be due to your setting of the security option of your browser. If it's IE, check the option in the menu 'tool->internet option...'.

64.Re:Manual of Volume-one wanted!  
名前:増谷佳孝    日付:9月18日(日) 15時24分
Why don't you dowload it in the manual page?
The link is still valid.

62.Re: Manual of Volume-one wanted  
名前:増谷佳孝    日付:9月16日(金) 12時16分
We currently provide an English version of the manual only for an older version (1.32). But, most of the functions are identical to the new version

Sorry for inconvenience.

(Chief of developer group)

61.Re:新バージョン  
名前:増谷佳孝    日付:9月16日(金) 11時14分
 VOLUME-ONE起動時の”glTexImage3D unavailable”のメッセージは、3Dテクスチャに非対応のグラフィクスカードを使用しているときにでるもので、新機能である3Dテクスチャによる高速なレンダリングはできませんが、その他は、特に問題はありません。

(dTVに関してはdTVの掲示板でお知らせします)

57.新バージョン  
名前:zhangyu    日付:9月8日(木) 7時32分
volume-oneとdTV-IIの愛用者でした。
新バージョンのvolume-one1.72とdTVII-SRをダウンロードしましたが、dicom画像の読み込みはできませんでした。volume-one1.72起動したところに、glTexImage3D unavaliable というコメントがありました。そしてdTVII-SRにてdicomを読み込むときに、system cannot find the path specified というコメントでした。(古バージョンは普通に使えますけど。。)
どうな問題が起こったでしょうか?教えっていただきたいです。

56.バージョン1.72リリース  
名前:増谷佳孝    日付:9月1日(木) 16時39分
バージョン1.72をリリースしました。
3Dテクスチャのレンダリングが可能になりました。

55.Re:MRI画像のFusionについて  
名前:増谷佳孝    日付:6月14日(火) 19時42分
>DTVとSPGR(またはthinsliceT1)をFusion
dTVを使ってDTIから抽出したtractとSPGRのFusionという意味でしょうか?
DTIデータに任意のデータ(今回はSPGR)を末尾にチャンネル追加して、dTVのROI
パレットに表示している状態でvoxelizeすればできるはずです。
追加するチャンネルの位置がDTIとずれている場合は下記を使用して下さい。
英語ですが使い方も書いてあります。
http://www.ut-radiology.umin.jp/people/masutani/RegiSTAR3D.htm


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